מחקר חדש מראה כי אין מספיק ראיות כי לניקוי המעי הגס יש תועלת אמיתית. למעשה,המחקר מדווח  כי ניקוי של המעי הגס יכול לגרום לתופעות לוואי חמורות החל מהקאות עד כדי אי ספיקת כליות ומוות. שיעור המוות מסרטן המעי הגס ירד ב -15 השנים האחרונות, וזה יכול להיות בגלל מודעות מוגברת לטיפולי ההקרנה ולגילוי מוקדם על ידי  קולונוסקופיה.

ניקוי המעי הגס או הידרותרפיה הגס כרוכה בשימוש בכימיקלים ולאחריו שטיפה במים דרך צינור המוחדר לרקטום. עשרים מחקרים שנעשו בעבר על טיהור המעי הגס שפורסמו בעשור האחרון נותחו על ידי חוקרים אשר מצאו מעט עדויות כי הנוהל מציע יתרונות. במקום זאת, מספר מחקרים ציינו תופעות לוואי כגון נפיחות, התכווצויות, חוסר איזון אלקטרוליטי הקאות, אי ספיקת כליות.

ישנן ומנוגדת זאת. מחבר הדו"ח, ד"ר רנית מישורי, רופאת משפחה וחוקרת באוניברסיטת ג'ורג'טאון לרפואה מסבירה:


"לא יתכן כי יש השלכות חמורות עבור אלו שעברו ניקוי מעי הגס אם אותם אנשים הלכו למקומות מקצועיים אשר טיפלו בהם בחומרים משלשלים, תה, כמוסות ואבקות tout אשר מציעים  יתרונות שאינם קיימים. "


עם זאת, אמר דיק הוניניגר, דובר האגודה הבינלאומית לקולון הידרותרפיה (I-ACT), אשר מפקח על NBCHT בהכחשה:


"כאשר קולון הידרותרפיה מבוצע על ידי מטפל מיומן באמצעות ציוד ה-FDA רשומים speculums חד פעמי או חרירי רקטלית בטוח המחקר שנערך מערבב בין חומרים משלשלים, לבין תרופות צמחיות,.. ו קולון הידרותרפיה רוב המחקרים הפניה הן לשימוש של חומרים משלשלים, לא מטפלים קולון הידרותרפיה. I-ACT מאומנים לשימוש נכון [ניקוי המעי הגס] הציוד נאמר שלא לעשות כל ההצהרות או פרסומות, כי לא ניתן לאמת בספרות סקר עמיתים ".


I-ACT יש ארבע רמות הסמכה. הרמה הראשונית היא רמה הקרן. הרמה השנייה היא רמת ביניים, ואת הרמה הגבוהה ביותר של ההסמכה היא רמה מתקדם. כדי להכשיר אחרים בתחום קולון הידרותרפיה אחד חייב להיות מאושר על ידי I-ACT ברמת המורה.

סרטן המעי הגס ניתן כמעט תמיד לגילוי על ידי קולונוסקופיה בשלבים המוקדמים ביותר לריפוי. כמעט כולם גברים ונשים מגיל 50 ומעלה צריך צילום CT  לגילוי סרטן המעי הגס.
בדיקות סקר לגילוי סרטן המעי הגס יכולים  לעיתים קרובות למצוא פוליפים לפני שהם הופכים לסרטניים. הסרת פוליפים אלו עשוי למנוע את סרטן המעי הגס.

שינוי בתזונה ובאורח החיים חשוב. הראיות הראו כי תזונה דלת שומן ועשירה בסיבים עשויה להפחית את הסיכון לחלות בסרטן המעי הגס.

מספר מחקרים דיווחו כי NSAIDs (אספירין, איבופרופן, נפרוקסן, celecoxib) עשויים לעזור להפחית את הסיכון לחלות בסרטן המעי הגס. עם זאת, תרופות אלו יכולות להגדיל את הסיכון של דימומים ובעיות לב. רוב הארגונים לא ממליצים לרוב האנשים ליטול תרופות אלו בכדי למנוע סרטן המעי הגס. שוחחו על דרכי המניעה של סרטן המעי הגס עם הרופא המטפל שלכם לפני נטילת תרופות אלו.