תופעות הלוואי של טיפול בסרטן תלויות בסוג הטיפול והן עשויות להשתנות מאדם לאדם. רופאים ואחיות יכולים להסביר מהן תופעות הלוואי האפשריות, ולהציע דרכים להקל על תסמינים היכולים להופיע במהלך הטיפול ואחריו.

• תופעות לוואי לטיפול בניתוח של סרטן הוושט יכול לגרום לכאבים ורגישות באזור הניתוח בטווח הקצר, שניתן לטפל בהם בתרופה. החולים מקבלים הדרכה ותרגילים בנשימה ושיעול, מה שמסייע לריאות להישאר נקיות.

• תופעות לוואי לטיפולי הקרנה משפיעים על תאים נורמליים כמו גם על תאים סרטניים. תופעות הלוואי תלויות בעיקר במינון ובאזור המטופל. תופעות לוואי נפוצות של הקרנות לוושט הן יובש וכאבים בפה ובגרון, קשיים בבליעה, נפיחות בפה ובחניכיים, עששת, עייפות, שינויים בעור באזור המטופל, ואובדן תיאבון. ראה הרחבה בנושא תופעות לוואי לטיפולי ההקרנות

• תופעות לוואי לכימותרפיה, כמו טיפולי הקרנה, משפיעים על תאים נורמליים כמו גם על תאים סרטניים. תופעות הלוואי תלויות בעיקר בתרופות הספציפיות והמינון שלהן. תופעות לוואי נפוצות של כימותרפיה כוללות בחילה והקאות, חוסר תיאבון, אבדן השיער, פריחה וגירודים בעור, פצעים בפה ובשפתיים, שלשולים, ועייפות. תופעות הלוואי הללו חולפות בדרך כלל בהדרגה במהלך תקופות ההחלמה בין הטיפולים או לאחר סיום הטיפולים. ראה הרחבה בנושא תופעות לוואי לטיפולים הכימותרפיים

• תופעות לוואי לטיפול בלייזר יכול לגרום לכאב קצר-טווח באזור המטופל, אך ניתן להפחית אי נעימות זאת באמצעות תרופה.

• תופעות לוואי לטיפול פוטודינמי גורמים לעור ולעיניים רגישות רבה לאור למשך 6 שבועות או יותר לאחר הטיפול. תופעות לוואי זמניות אחרות של טיפול פוטודינמי עלולות לכלול שיעול, קשיים בבליעה, כאבי בטן וכאבים בנשימה או קוצר נשימה.